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有的细菌有刺激子实体形成的作用。如双孢蘑菇栽培的覆土中，有一种细菌可以吸收双孢蘑菇菌丝体呼吸所产生的二氧化碳，降低培养料中二氧化碳的浓度，从而刺激双孢蘑菇子实体的形成。刺激食用菌子实体形成的细菌广泛存在于土壤中，灰树花、鸡腿菇、大球盖菇等子实体的形成都需要这类细菌的刺激。