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担孢子萌发需一定的条件，这包括其内在的生理条件和外部适宜的环境条件。内在的生理条件主要要求孢子成熟、核相正常，外部环境条件主要要求适宜的温度和充足的水分，有的种类还需一些萌发的诱导物。这些种类，当没有诱导物时，很难萌发，或萌发不整齐。在人工栽培的种类中，萌发比较困难的有双孢蘑菇、草菇和灵芝，比较易于萌发的有香菇、金针菇和平菇。

担孢子萌发的第一步是吸水和膨胀，在特定的温度和营养条件下几日后便可生出芽管。担孢子萌发的温度多高于其菌丝生长的适宜温度2～3℃。