枣树的根系活动与土壤的温度、湿度及通气状况、养分状况密切相关。适宜的条件可促进根系的活动。

枣树根系在土壤中分布很广，一般能超过树冠的3~6倍，但大部分根系集中分布在树冠下较小的范围内。垂直根分布深度达1~4米以上，一般是树高的二分之一，吸收根多分布在0~30厘米。

根系的生长活动一般早于地上部，以毛细根活动最早。大体在芽萌动的前10~15天根系开始活动。此时由于温度低，活动较缓慢，进入萌芽后期，土温上升加快，根系生长加快，一般在华北地区7月中旬至8月中旬，活动最旺盛，进入9月根系生长下降，11月上中旬以后生长逐步停止。

一般大的骨干水平根、垂直根活动较缓慢，生长高峰持续的时间短。

枣的根系抗旱耐涝性比其它果树强，对水分的需求范围较宽。但长时间的干旱缺水或涝灾，也会给树体造成不良影响。