1.禽流感
本病是由流感病毒引起的急性传染病。番鸭发病率较高，危害性较大，一年四季均可发生。
主要症状：体温升高、精神沉郁；头部肿大、流泪水，羽毛松乱；呼吸困难；胸肌、腿肌、心外膜、腺胃与肌胃粘膜、十二指肠粘膜等处出血，胰、肝、脾和肾有灰黄色坏死灶，泄殖腔充血、出血和坏死，典型病变是淋巴滤泡的环状增生。
防治方法：①严禁从禽流感疫区引进鸭苗，防止病原入侵。②疑似病鸭应尽快隔离、送检、确诊。③带鸭消毒，可使用菌毒灭、消毒威和禽感快克等消毒剂。④接种禽流感灭活油乳剂疫苗。⑤使用禽流感特效药感毒清进行预防或早期治疗（100千克水加感毒清100～200克）。⑥肌注禽流感高免蛋黄518抗体或新瘟疫抗体。⑦适当使用抗感染、抗应激药物。有条件的可肌注干扰素和白介质素等，每羽0.8～1毫升，隔2～3天注射1次，连用2～3次。
2.雏鸭病毒性肝炎
本病由滤过性病毒引起，是一种传播迅速、死亡率高的烈性传染病。病毒主要侵害3周龄以内雏鸭，死亡率达100%。
主要症状：幼鸭多为突然发病，表现精神萎靡、缩颈拱背、脚软站立不稳、离群、眼睛半睁半闭、呈嗜眠状态。有些病鸭排青绿色或白色液状稀粪，后期出现运动失调，死前呈角弓反张；肝脏肿大，质脆，容易撕裂，呈土黄色（首次感染10日龄内的占半数以上）、褐黄色、黄白色，肝表面有大小不等的深紫色出血点、斑状条纹或坏死灶；胆囊肿大，胆汁稀薄；脾、肾有不同程度肿大、充血、出血等。
防治方法：①雏鸭免疫。1日龄雏鸭用鸭病毒性肝炎弱毒疫苗免疫，注射后5天可产生较强免疫力。②应用蛋黄或血清抗体防治。雏鸭出壳3天，腿部皮下注射蛋黄或血清抗体液0.5～1毫升，初发病鸭立即注射1～2毫升，能起到预防和治疗作用；重病鸭隔12～36小时重复注射1次，治愈率达95%左右。③辅助治疗可采用饲料中加入病毒灵1.5～2克/千克饲料；或在饮水中（饲料中）加入氟哌酸粉0.1%～0.25%和敌克，连喂3天。
3.番鸭细小病毒病（三周病）
本病由细小病毒引起，是雏番鸭的一种急性传染病。病理变化是纤维素性肠炎，胰脏呈点状坏死。以 3周龄内的雏番鸭多发，最早在3日龄发病。病鸭张口呼吸、喘气、消瘦、拒食、蹲伏，十二指肠内容物呈松散栓子状，表层有脱落粘膜附着。
防治方法：①1日龄用番鸭二联苗每羽皮下注射1头份。②发病鸭每羽肌注番鸭二联高免血清1～2毫升，可适当加入氨苄青霉素或庆大霉素等抗菌类药，以防继发感染。
4.鸭浆膜炎
本病由鸭疫里默氏杆菌引起的急性传染病，主要发生在5周龄内的雏鸭。病鸭是本病的传染源，健康鸭通过呼吸道、消化道感染，此外脚蹼创口也是重要的感染途径。低洼潮湿场地的鸭群尤易发病。病鸭行走不稳，甚至瘫痪，排绿色或白色稀粪，剖检呈心包炎、肝周炎和气囊炎。
防治方法：①肌注三包针或制菌璜等。②口服鸭疫三日清，或土霉素，或鸭浆炎等。
5.番鸭花肝病
该病以番鸭的肝脏出现花斑样病灶为特征。具有发病快、病程短、传播迅速、高发病率和高死亡率等特点。本病最早可见于7日龄的雏番鸭，通常多见于10～25日龄的番鸭群。发病率最高达100%，病死率通常在30%以上，有的感染严重的番鸭群会出现全群死亡。
主要症状：急性死亡病例往往看不到明显症状，病程稍长的可见病番鸭精神倦怠，羽毛蓬松、直立、无光泽，全身乏力，脚软，呼吸急促。濒死番鸭全身震颤，卧地不起，最后衰竭死亡，病程一般为2天左右。病变的肝脏出现灰白色斑样病灶，病灶大小不一，自针尖到米粒大小，边缘不整齐，无光泽，脾脏肿大，呈黑紫色斑点状；胰腺苍白，表面有白色细小斑点，形状呈圆形较规则。
防治方法：主要采用疫苗接种和加强饲养管理的综合性防治措施。①1～3日龄，每羽肌注鸭花肝灭活疫苗0.2～0.3毫升，或5日龄前后每羽雏番鸭肌肉或颈部皮下注射0.5毫升疫苗。②治疗采用番鸭花肝病高免蛋黄液；同时配合免疫增强剂、多维素和广谱抗生素等。