据地质史料分析:紫云山系加里东造山运动中崛起、燕山造山运动中形成高山峡谷。这里既有典型的亚热带气候,又有地方性少变小气候,当第四纪冰川袭击时,它因四面环山的走廊式地形,从而避免了冰川的侵入,因此,成为动植物理想的“避难所”,保存了热带、温带、亚热带多种植被。
据初步调查,这里有木本植物105科,334属,940多种。其中属国家保护一、二、三类珍贵树种有28种。紫云山顶有一棵“银杏王”,身高35米,胸径2米,树龄愈千年,仍虎虎有生气,被誉为“寿星树”。还有一颗连香树,一树萌出七棵,互相提携,亭亭玉立,人称“七姐妹”。每年四月,先花后叶,或鲜红、或紫色,在阳光的照射下,呈现七彩云光,瞬息变幻、绚丽如霞。山坡沟谷遍布奇花异草,仅杜鹃花就有20多种。
这里药用植被达700多种,有药中三宝:竹节人参、灵芝、天麻草;有珍贵的黄莲、杜仲、香榧、厚朴、回阳草、七叶一枝花。富绕的绿色走廊是动物的乐园。据初步调查,有动物资源60多种,列入国家重点保护的有水鹿、苏门羚、大灵猫、穿山甲、华南虎、红面猴、毛冠鹿、锦鸡、铜鸡、金钱豹、黑熊等21种。