牛门洞新石器遗址位于县城西北头寨子镇牛门洞村，面积约16平方公里。牛门洞周围的大地梁、庆条湾、清明湾、中湾顶、华岔阴山等山梁的阴面，多为墓葬区。1920年当地秦安移民垦荒时首次出土彩陶罐。70年代农田基本建设中，发现在上述山梁深1米处，每间隔1米，即有墓穴，内有大量壶、瓮、罐、钵盆等彩陶及骨球、石器、刮削器、纺轮等随葬品；并在生活区出土大量陶器，制罐工具、生活用具、石祖、石、权杖头等。文化层厚1—2米，鉴定属马家窑文化马厂、半山类型。1982年，甘肃省人民政府将其列为省级文物保护单位。牛门洞新石器遗址为全国重点文物保护单位。