天然湖泊都有它的形成、发展和老化的演替过程。所有各类不同的养鱼湖泊自然条件差异较大。有的湖泊已发展到浅化或沼泽化阶段,其自然条件较差,要经过改造以后才能提高渔业生产力。有的湖泊鱼产量虽已超过750千克/亩或更高,如能进一步改善其渔业生产条件,鲜鱼产量会更高。因此,特别是在湖泊综合养鱼生产上要十分重视自然条件的改造。改造湖泊自然环境,以适应发展综合养鱼的需求,主要应围绕三个方面工作去做:
    (1)渔、农、牧生产区的划分和改造 首先要依据湖泊自然条件,因湖制宜地制订出发展规划,根据规划执行湖区改造。有的湖泊只要利用原有自然条件,稍稍加以改造,就可利用水面养鱼;利用沿岸种植饲料作物或发展畜、禽饲养业。如往深度发展,可按面积比例划分成不同专业生产区域。例如水面可划分成深水区和浅水区;沿岸划分为饲料种植区和畜、禽饲养区。深水区养鱼,浅水区发展经济水生植物,如种植莲藕、菱角等。
    (2)经济鱼类生活环境的改造 鱼类生活环境的改造,主要是扩大有利于鱼类活动的水域,提高鱼类天然及人工饵料基础;以及合理地控制野杂鱼类。有的湖泊发展到老年期,大型水生植物面积扩大,形成草型湖泊,开始可以多放养草鱼控制水草,以腾出养鱼水面。有的湖泊已经沼泽化,也可结合农田水利建设进行改造,例如湖北省汉川的刁汊湖,原先已成荒湖,淤泥厚,经过综合治理和改革,全面安排灌溉、航运、绿化、养鱼,开挖深沟大渠,控制了水位和水面,为发展养鱼创造了有利条件。为了繁殖鱼类的天然饵料,有的就利用沿岸饲养畜、禽,还可移植一些底栖生物类的天然饵料。适当地清除凶猛鱼类,可提高放养鱼种的成活率。
    (3)鱼类繁殖条件的改良 主要包括天然产卵场的保护和改造以及人工产卵场的建造等工作,以保持和提高经济鱼类自然再生产能力。