斑点叉尾鮰的鱼病防治是养殖过程中的一个重要环节，尤其在高密度养殖中更为重要，应切实做好防病治病工作，落实“无病先防、有病早治、防重于治”的方针。 

　　1、水霉病

　　病原:水霉

　　病状:被感染后的鱼，其身体的任何部位均会长出或小或大丛的灰白色棉花状菌丝体。捕捞、产卵等操作造成的损伤或其它疾病引起的病灶通常会使水霉菌侵入感染。全年均可发生此病。

　　防治:目前尚未有有效的防治方法。捕捞、运输和放种过程中尽量不要使鱼体受伤；用2%食盐水、2%小苏打洗浴10-15分钟或3%食盐水洗浴15-20分钟。