现代柑桔苗木一般采用嫁接苗，它由两部分组成：砧木和接穗。
　　品种固有特性一般由接穗表现。 
　　根据柑桔生态区划指标，在最适宜区和适宜区选择优良品种栽培。特别注意选择有较强抗病性、抗逆性的品种。溃疡病区优先考虑种植宽皮柑桔。溃疡病是一种细菌性检疫性病害，它可随着种子、苗木、接穗和果实而传播，每年因为它的发生至少要多喷 5-10次药剂，既增加生产成本，又增加果实中农药的残留。而宽皮柑桔感病较轻，因此，溃疡病区最好种植宽皮柑桔。
　　砧木：20世纪50年代以前，柑桔果树以实生繁殖为主。60年代起，随着薄膜在嫁接苗上的使用和优良砧木的推出，嫁接繁殖遍及全国柑桔产区，改变“柑八年”为3年开花结果，柑桔树改乔化为矮化。由于各地气候、土壤和病虫害等原因，选用砧木差异较大。必须选择适合当地气候、土壤和抗病虫害的优良砧木。我国砧木品种已基本区域化，各柑桔产区都有相适宜的砧木供生产发展需要，各种砧木也有其相适应的品种即砧穗组合。选、引用部分抗性砧木．，如抗病、抗盐碱、抗冻害等。
　　常用砧木有：枳、枳橙、香橙、枸头橙、红桔、朱桔、酸柚和酸桔等。盐碱土和石灰性紫色土宜选用构头橙和香橙等，已感染裂皮病和碎叶病的品种(系)不能用枳和枳橙作砧木。
　　现新建果园，特别是高标准果园都采用脱毒苗。我们也建议无公害柑桔生产基地在建果园时如果有条件，尽量选择种植脱毒苗。脱毒苗的繁殖方法与常规育苗不同，它的培养土、繁殖用的器具、设施，使用前均经过严格消毒，灌溉水是达标的，砧木种子也是无毒的，接穗的母树必须经过鉴定或注册的已脱毒或无病毒的檀株。繁殖过程中严格保护，以免染病。脱毒苗不带任何病毒类病害，因此，在田间种植后生长迅速，长势好，抗病力强，病虫害少。