我国大多数柑橘种类的花芽分化是在10月至第二年春季萌芽前完成的。花芽分化的时期与当年气候、品种、树势和结果量等条件有关。秋季气温较高，冬季低温干旱，花芽分化早。萌芽早的橙类，其花芽分化较桔类、柑类早。春梢母枝花芽分化比夏、秋梢早。大年树花芽分化晚于小年树，而一年多次开花的柠檬、金柑等品种，对花芽分化的条件要求不严格，花芽分化过程也较快，冬季枝条抽生一个月，即能完成花芽分化，陆续开花结果。花芽分化分为生理分化期和形态分化期。生理分化期先于形态分化一月左右，累积组建花芽的营养物质、激素调节物质、遗传物质等，共同协调作用的过程和结果，是各种物质在生长点细胞群中，从量变到质变的过程，为形态分化奠定物质基础。这时的叶芽生长点组织，尚未发生形态分化。
　　生理分化完成前后，在植株体内激素和日照、温度等内、外界条件调节影响下，叶原基的物质代谢及生长点组织形态开始发生变化，逐渐可区分出花芽和叶芽，这就进入了花芽的形态分化期，并逐渐发育形成花萼、花瓣、小蕊、雌蕊，直到开花前才完成整个花器的发育。通常说的花芽分化期，即指形态分化时期。