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菌丝洁白、浓密、粗壮、鲜嫩，菌丝生长边缘整齐，比上述三种菌丝都粗壮而浓密。多数品种在培养基上方表面形成绒毛状气生菌丝，低温品种的气生菌丝常分泌黄色或黄褐色色素，特别是在高温季节，低温品种常出现“黄梢”，分泌黄色至黄褐色水珠，这都属正常现象。

如果菌种体上部菌丝稀疏、灰暗、无力、干瘪，而下部或生长边缘正常，表明培养温度过高、湿度过大、通风不良，或有大量细菌生长。如果菌种体表面出现白粉状物，表明培养温度过高。在较晚发生毛霉污染时，平菇菌丝常能将毛霉菌丝遮盖，不经仔细观察，很难发现污染。没有菌种生产经验的人常把其作为正常菌种使用。在这种情况下仔细观察，可发现菌丝分布较乱，且色泽较暗或稍黄，菌丝也显更密集。完成培养后，在25℃以下，多数品种易在上表面形成子实体原基。