鸡粪是一种非常优质的有机肥料，但在施用中也是很重要的，施用不当，不但达不到施肥的目的，而且会得不偿失，反而会引起反作用。
　　
　　鸡粪中含有机物约25.8％，氮素1.63％、磷酸1.54％、钾0.82％，还含有钙等微量元素。如果鸡粪直接施用，没有经过腐化，发酵，直接用于农作物上，则会引起以下这些反作用：
　　
　　一、土壤缺氧：有机质在分解过程中消耗土壤中的氧气，使土壤暂时性的处于缺氧状态，会使作物生长受到抑制。
　　
　　二、传染病虫害：粪便中含有大肠菌、线虫等病菌和害虫，直接使用会导致病虫害的传播、作物发病，对食用农产品的人体健康也产生影响，未腐熟有机物料在土壤中发酵时，容易滋生病菌与虫害，也导致植物病虫害的发生。
　　
　　三、毒气危害：在分解过程中产生甲烷、氨等有害气体，使土壤和作物产生酸害和根系损伤。
　　
　　四、肥效缓慢：未发酵腐熟的有机肥料中养分多为有机态或缓效态，不能被作物直接吸收利用，只有分解转化成速效态才能被作物吸收利用，所以未发酵有机肥直接施用时使肥效减慢。
　　
　　五、发酵烧苗：不发酵的生粪等有机物料施到地里后，当发酵条件具备时，在微生物的活动下发酵，当发酵部位距根部较近且作物植株较小时，发酵产生的热量会影响作物生长，烧毁作物根系，严重时导致植株死亡。