基因组文库(Genomic Library)是指将某生物的全部基因组DNA切割成一定长度的DNA 片段克隆到某种载体上而形成的集合。基因组文库根据DNA 来源又分为核基因组文库、叶绿体基因组文库及线粒体基因组文库。基因组文库构建时遗传信息供体是基因组DNA,因而无发育时期及组织器官特异性，在一个完全的基因组文库中包含着基因组DNA 上的所有编码区及非编码区序列的克隆; 生物有机体的每一个基因在文库中都有其克隆，该克隆的基因片段里包括着间隔序列，所以基因组文库可真实地显示基因组的全部结构信息。

      但是如果细胞或者细菌死亡了，这些DNA片段与细胞、细菌内的染色体进行了重组，加上了复制原件之类的必备“元器件”，变成细胞、细菌的组成成分，可以随着细胞或细菌的分裂繁殖，不断地复制。因此基因组文库不是静态的，而是动态的储存。这些被改装过的DNA片段，在分子生物学上称为重组DNA。原来，基因组文库就是简化的“转基因”。

      做基因组文库为的是下一步的分子杂交（molecular hybridization）。

      基因组文库就好比一堆锁眼被堵住的形形色色的锁头，每把锁头就是一个目的基因。分子杂交，就是把堵住锁眼的物体拿掉，拿着钥匙逐个去试锁，直到找到匹配的那把锁。这里的“钥匙”，是指根据目标基因的部分序列信息，合成的一小段DNA单链序列；“锁头”指的是目的基因。

      分子杂交是把基因组文库汇总的双链DNA解开，变成单链，然后加入短序列的DNA（钥匙），找到彼此匹配的较长的DNA片段（锁头）。找到若干“锁头”后，根据这些DNA序列中重叠的区域，按顺序重新排列DNA片段，再用DNA剪切酶和链接酶剪切和粘贴，一个完整的目的基因序列就得到了。

      构建基因组文库，再用分子杂交等技术获取基因克隆，当生物基因组比较小时，此法较易成功；当生物基因组很大时，构建完整的基因组文库本身就非易事，而要从庞大的文库中去获取目的基因，工作将更加浩繁。