荧光假单胞菌是一种重要的植物根际促生细菌，大部分都具有防病增产作用，因而可用于植物病害的生物防治。 荧光假单胞杆菌产生的抗生素是它们抑制植物病害的重要因素，可预防青枯病、软腐病、小麦全蚀病、立枯病和枯萎病等多种土传病害，减少病害发生。另外，荧光假单胞杆菌还可以产生生长素类物质，促进作物根系生长，解决烂根问题。针对近几年小麦主产区域全蚀病突发问题，“全蚀净”配合“荧保素（荧光假单胞菌）”拌种预防全蚀病在河南已经取得了不错的效果。