芹菜软腐病为细菌性病害，发病芹菜近地面的叶柄变为米黄色，软腐后倒下，病株具特有的恶臭，易和别的病害相区分。土壤中的软腐病菌，随降雨时的土粒反溅，由芹菜叶柄下部与地面接触处的伤口和害虫食痕处侵入。中耕和风雨后发病株增多。病菌在土中残存，因此应避免与易发生软腐病的十字花科蔬菜连作。
　　
　　该病在春秋多湿状态下发生十分严重，要特别注意田间排水，避免密植，加强通风。药剂防治可选用７２％农用链霉素可溶性粉剂５０００倍液，或新植霉素５０００倍液，５０％ＤＴ可湿性粉剂１０００倍液，５０％加瑞农可湿性粉剂５００～６００倍液，７７％可杀得可湿性粉剂５００倍液，每隔７～１０天喷一次，连续喷雾２～３次。