当前的农药种类很多，因此在选择应用农药上应根据具体问题具体分析，如杀虫剂当中的敌百虫，一般对咀嚼式口器的害虫，如菜青虫等有效，而对蚜虫、介壳虫等刺吸式口器的害虫，则几乎无效。杀菌剂也是如此，一般种子消毒或土壤处理多选用广谱性的，而防治茎、叶的真菌性病害，则选用针对这种病原菌起作用的杀菌剂类型的农药，在绿色中药材生产的病虫害防治上，要尽量使用生物制剂，如多抗霉素等。