淮南湿地自然保护区位于河南省东南部，淮河中上游，地理座标为北纬32°15′—32°38′，东经115°10′—115°35′，属北亚热带与暖温带气候过渡地区，光热资源丰富，四季分明，降水丰富，年平均温度为15.3℃，无霜期年均224天，降水量年均936.8毫米，年日照均为2124.4小时，日照率为48%，年均风速为3.1米/秒。
该区位于淮河上游，正处在我国第二阶梯向第三阶梯过渡地带，又是我国自然地理区划的暖温带与北亚热带的过渡地，具有较强的代表性。地形由西向东倾斜，由北向南逐渐降低，大体可分为岗地、平原和洼地三种类型。岗地主要分布在淮河以南，地面高程变化在32.5米到52米之间；平原属于黄淮平原范围，主要分布在淮河以北，地面高程变化在33米至42米之间，坡度一般为三千分之一到五千分之一；洼地主要分布在淮河、乌龙港沿岸，地面高程变化在25米至33.5米之间，地势低而平坦。
过渡带的气候特征，丰富的水热资源，使该区蕴藏着丰富的植物资源，植被类型多样，植物种类繁多，乔、灌、草交错，渗透，湿地植被类型多样，植物群落共有7个植被型组，12个群系，200个群丛。其中以亚热带常绿、落叶阔叶林为主兼有暖温带的植被种类。据调查，该区有湿地植物80多科，1000多种，湿地维管植物30多科120属200多种。有木本湿地植被12类；草本湿地植被11类；水域植被有狐尾澡群落、黑藻群落、茨藻群落、苔藻群落、荸荠群落、野慈姑群落、狸群落、空心莲子群落、雨久花群落等22个。
保护区处秦淮一线，独特的地理位置和良好的自然资源使这里成为“动物的王国”。鸟类资源丰富，有128种，占全省鸟类总数的43%，其中东方白鹳、金雕、大鸨等3种为国家一级保护鸟类；国家二级及省重点保护的有白冠长尾雉、蓝翅八色鸫、白琵鹭、草鴞等95种。兽类有13种，两栖爬行类19种，如水獭、大灵猫等为国家重点保护动物。昆虫类已经标本鉴定的有700多种，尚有许多未知种类，其生物资源非常丰富。
淮滨淮南湿地自然保护区自建立保护区后，加强资源保护，进行自然保护区本底资源调查，开展科学试验，充分发挥自然保护区的生态、社会、经济效益，使保护区成为保护和研究生物多样性、生物群落演替、生态系统结构、功能和生态效益的理想基地。
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