沿额尔齐斯河两岸生长的杨树有上百种,主要树种有青杨、苦杨、银白杨、黑杨、额河杨、胡杨、尖果沙枣、白杨等,主要特点是品种多、生长快、林质好,有多种特殊用途。世界上五大杨树派系中的四大派系青杨、白杨、胡杨、黑杨都集中在这里,特别是欧洲黑杨,因其数量少而倍加珍贵。流域内的河谷天然林属湿带落叶阔叶林类型,以湿生、中生杨树为主,旱生为铺。
额尔齐斯河气候属荒漠及半干旱荒漠大陆性气候,东部受蒙古高压影响,北部受北冰洋与西伯利亚寒流控制,因此,寒潮和水气沿额尔齐斯河谷进入阿尔泰山区,对植物的生长和动物的繁衍起了很大的作用。根据气候表明,额河全年少雨、冬春严寒、多风雪、温差大、日照长,但水资源丰富,构成了额河少有的生态条件。这里的动物常见的有:鹅喉羚、盘羊、野猪、草兔、水獭等。爬行类11种,有;绿蟾蜍、花蛇、草原蝰等;鸟类有欧夜鹰、灰伯劳、兰点额、红尾鸲、黄胸等。
这里植物群落的多样性造就了水禽的多样性,高大的杨柳、浓密的芦苇,为这里的水禽提供了隐蔽的场所,这里生长着冷水性淡水鱼种,常见的有:小体鲟、白斑狗鱼、哲罗鲑、长颌白鲑、拟鱼鲳等10鱼种。
额尔齐斯河不仅孕育着阿勒泰人民,而且还润育着数千万亩优良的天然草场、农业灌溉、水能和水产,阿勒泰人民称之为母亲河。