自然保护区管理处为正科级事业单位,下设湿地宣教中心、监测巡护站、森林派出所保护区执勤室等宣教和管理机构。西洞庭湖自然保护区地处沅、澧水尾闾,它不仅承接沅、澧二水,而且吞吐长江松滋、太平二口洪流,汉寿县南部低山丘陵区为雪峰山余脉,其间沧水、浪水、龙池河、烟包山河等8条河流也由南向北流入西洞庭湖,使得保护区内洲滩密布,江湖交错,水域辽阔,形成了其独特的地形地貌和湿地景观,“涨水为湖、落水为洲”为其主要特征。西洞庭湖是长江中下游地区一个典型的过水型湖泊,这里春夏涨水时,洪水滔滔、水天一色,秋冬枯水季节,则洲滩显露、沟港纵横、芦荡深幽。
本区属中亚热带季风气候区,气候温和,日照充足,雨量充沛,年均气温16.7℃,降水量1200—1350mm,无霜期274天,暴雨是区内的主要灾害天气。
西洞庭湖湿地由沅、澧汇聚而成,有水浸皆湖,水落为洲的沼泽地貌特征,西洞庭湖衔远山、吞长江,碧波万顷,浩无涯际,素以气象万千、美丽富饶闻名天下。这一带港汊迂回,丘峦突兀,湖外有湖,湖中有岛,渔帆点点,芦叶青青,鱼跃水底,鸥鹭翔飞。春秋四时景色不同,一日之中千姿百态。寒风吹浪千里雪,大有北国风光的景色;落日西沉万顷金,与登泰山观日出异曲同工。
境内河汊纵横,洲岛密布,广阔的湖面上星罗棋布地散布着140个人迹罕至的湖洲和湖岛。这里土地肥沃,气候温暖湿润,四季分明,物产丰富生长着湿地植物865种、鸟类207种、鱼类114种。其中国家一级保护动物有中华鲟、白鹤、白头鹤、中华秋沙鸭等10多种。湖洲芦苇面积达5.4万多公顷,是世界上最大的苇荻群落之一。这里湖面宽广,水草繁茂,水产动物极多,自古盛产鲤、鲢、鳜、鲭、鳊、鲰、银鱼、草鱼、凤尾鱼和龟、鳖等各种淡水鱼称得上天然特种水产基地,湖洲上野生的绿色食品野芹菜、野藜蒿、芦笋和蓼米被誉为“洞庭四珍”倍受人们珍爱。