佐海黑教寺的主要法事有,每年春季正月十五举行析愿0会和供佛法会;夏季举行修持法会并进行坐夏;冬季举行消灾回遮法事,跳法舞。另外,坚持显密兼修,寺内经常举行普明、普空、药师、时轮等法会;每月上旬、下旬举行长善净恶仪轨等。
佐海寺有大经堂一座, 内供奉有苯教祖师的几尊大佛像,和十六罗汉以及显密卷轴画像,藏经《甘珠尔》等经卷二百余函。经堂的门楼和天窗上布满红黑旗旌,比之其它寺院更显神密而深暗。该寺现有僧人30多名,僧舍30余间。其经堂和僧舍及部分法事活动可供游人参观。
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