净水养鱼是以兼顾水环境保护的渔业生产，追求渔业生产和环境保护的协调发展，保持足够净化水质的鱼类数量，控制水质质量。变传统养鱼为净水养鱼，两者可相互依赖，谐调发展。

水库投放的鱼种主要为鲢鱼、鳙鱼、鳊鱼、鲂鱼、鲤鱼、鲫鱼等，这些鱼被统称为净水鱼。

鲢鱼是滤食性鱼类，以浮游植物为食，在水库中放养鲢鱼，可以充分利用水体中的浮游植物等天然饵料资源，同时体重每增加1斤，摄食过程中可吸收氮气14.5克，磷0.6克，碳水化合物57.8克，从而起到净化水质，确保水质安全作用。鳙鱼又称花鲢、胖头鱼，主要以浮游动物为食，也食部分浮游植物，可以抑制水体中的轮虫、枝角类和桡足类浮游动物其体重每增长1斤，在摄食过程中可吸收氮14.9克，磷0.85克，碳水化合物60.75克。鲢鱼、鳙鱼被称为水体的“过滤器”。

鳊鱼、鲂鱼是中层鱼，水体中的碎屑和藻类都是这两种鱼的主要食物。鲤鱼、鲫鱼是自然生长的土著鱼类，它们生活在水的底层，摄食水体底层的残饵和腐殖质，可清除大部分残余的有机物，大大减少水体底层有机物腐化分解释放的污染物。也是水底名副其实的“清洁工”。

另外，水体中的乌鳢、鲶鱼等凶猛性鱼类也算得上水体中的除杂先锋，能大量摄食水体中的野杂鱼、病鱼、死鱼、动物腐尸等，可以有效控制水体中的野杂鱼虾的大量生长繁殖，防治病、死鱼等污染水质，减少耗氧因素，降低小型鱼虾对浮游动物的摄入量，促进浮游动物对浮游植物的摄食，间接吸取水体中的营养物质，从而达到净化水质的目的。