笋壳鱼的收获分为平时捕大留小、选择上市和干塘一次性捕完。养殖过程中在塘边放置一些直径10-20厘米、长1米左右的直筒，直筒要开有多个小孔，利用笋壳鱼喜欢穴居的特点，收捕时双手堵直筒两头提起，水从小孔流出，挑选筒中符合规格的产品。笋壳鱼有钻泥不动的习性，干塘收捕时应注意捕捉干净。 
      
　　笋壳鱼离水后只要保持湿润、阴凉，可存活数十小时，非常有利于鲜活产品的运输。从东南亚箱运回来的产品采用每尾用塑料袋湿润充氧独立包装，每箱数十千克，经20小时仍存活完好。