柑橘杂色病毒（CVV）、柑橘叶皱病毒（CCLV）和柑橘皱叶病毒（CLRV）产生的症状一般都很微弱。其中CVV产生的症状最为明显，尤其是在柠檬、酸橙、香橼和葡萄柚上。在相同的品种上，CCLV产生的症状比CVV轻微，几乎观察不到CLRV在大多数的柑橘寄主上产生的症状，但在柠檬上CLRV会产生叶斑，并且在墨西哥来檬上出现皱叶。一般这三种病毒在甜橙和宽皮柑桔上症状轻微，仅在一些嫩叶上才会被发现。CVV能在果实上产生症状，但是没有对产量产生严重影响的报道。CVV和CLRV在不同的寄主上所产生症状的严重程度是不同的。一些由等轴不稳环斑病毒属病毒产生的症状与温州蜜柑萎缩病，柑橘萎黄矮缩病和鳞皮病的症状相似。