土壤中的有机质主要是生长在地面上的植物残余物形成的或者人为施用各种有机物，它的性状与数量，对于土壤肥力与形成作用都有密切的关系。土壤有机质可以分为两大类：新鲜有机物—形态、性状、组织，构造与活的有机物无区别，只是缺少生长机能；腐殖质—是有机体残余物经土壤微生物彻底改造以后形成的，是土壤中特有的无机体。
　　我国一般柑橘园有机质都在1~2%，国内外学者认为柑橘园土壤有机质含量3~5%，有利于柑橘生长，是满足柑橘丰产的土壤肥沃度的重要指标。土壤有机质的作用在于：对土壤物理化学性质有很大的影响，土壤团粒结构、透水性、持水量、通气、吸收量以及缓冲性等都决定土壤有机质；它含有无数微生物活体，同时也是微生物的养分和能量的来源；分解有机物逐步释放各种元素、完全养分，不易缺素；腐殖质酸对根系的发育有刺激作用；向土壤溶液、土壤空气和大气供应二氧化碳；有机酸在颇大的程度上影响到母质的化学风化过程，如对磷、铝、钾、镁等化合物由难溶性矿物的成分中转移到土壤溶液中的作用就会加强，容易被根系吸收。因此，柑橘园土壤管理应该做到使土壤有机质含量逐渐增长二不是逐渐下降。