长期进行生产育苗的专业苗圃，应进行规划，分区安排，利于管理。其中包括：

母本区：包括采砧木种子的砧木母本区及提供良种接穗的接穗母本区。砧木采种母对土壤要求不太高，可规划在土壤较差或坡度较大的零星地段，应离成年果园较远，以免自然杂交，引起砧木品种混杂，应采用等高栽植或用鱼鳞坑方式种植，以保持水土。接穗母本区应规划在土壤肥沃、深厚的地段。

轮作区：为减少病虫害和杂草滋生，应规划出轮作区，播种圃一年轮作，嫁接圃两年轮作。作物以覆盖面积大的豆科、薯类或蔬菜作物为宜。

附属设施：专业性育苗应有办公室、工具室内、贮藏室、消毒室、包装场、排灌设施及加盖的蓄粪池等。苗圃还应有主干道、每小区应有人行道，可车辆和人的通行，便于苗木的运输和管理，各区的排灌系统应能蓄水、灌水、排水，还有在风害地区应营造防风林。