柑桔砧木种子播种后应覆盖，包括覆盖土壤及松软覆盖物或薄膜。

覆盖土壤：要求用筛细的壤土或蛭石，也可用细石谷子。盖土厚1~1.5厘米。盖土太薄种子易露出土面，影响发芽或砧苗弯曲。不能用河沙作盖土，因河沙的保水和保肥力差，夏季升温快，易灼伤根颈造成立枯病病原菌侵入，引起幼苗大量死亡。

覆盖物：盖土后可用松软覆盖物，如稻草、松针、稻壳等，但不能盖得过厚，以免影响种子发芽。盖覆盖物的目的是保持播种地的水分和避免大雨冲刷播种畦面。用覆盖物覆盖后应浇足水分。

覆盖薄膜：如果提早在1月播种，可在覆盖土壤后不盖松软覆盖物，而用聚氯乙烯薄膜覆盖，以提高播种畦面土壤温度和保持水分。薄膜在畦面用竹条支撑成拱形，四周进入畦沟内。这种方法覆盖，种子在20~25天可发芽。薄膜内温度达30℃时应揭除薄膜。