自古至今，世间万物都会分为三六九等。对于不同的东西我们就应当不同的对待，那么对于不同类别的农药杀菌剂我们同样应该有不同的运用方法。

维护性杀菌剂：这类杀菌剂可以维护未被病菌侵染的施药部位免受病菌侵染，需求在作物没有接触到病或病害发作之前，喷药才可收到效果，如铜制剂(波尔多液)，硫制剂(石硫合剂)，代森锰等。

根除性杀菌剂：这类药剂能直接杀死入侵前的病菌和治疗已被侵染的施药部位，常有消毒作用。如用福尔马林消毒带菌种子。

治疗性杀菌剂：也叫内吸性杀菌剂，这类杀菌剂被植物吸收传导后，可阻止植株各个部位的病菌开展。如多菌灵、托布津、春雷霉素等。

不同类杀菌剂的运用办法不同。

种苗阶段系统维护：包括药液浸种、药液闷种、药剂拌种、种衣剂、药液浸蘸秧苗等。常用的药剂有拌种双、福美双等。种苗包括种子、块根、块茎、鳞茎、插条、秧苗、苗木及其它用于繁衍的器官。

药剂处置土壤：属整体或部分维护，如直接在苗床土壤中施药种类有五氯硝基苯等。处置土壤可用浇灌法、翻混法等。

叶面喷洒：叶面喷洒有多种剂型，如粉剂、微粉剂、可湿性粉剂、乳油、悬浮剂、水剂、烟雾剂等。