菌肥在蔬菜生产中应用越来越广泛，特别是对于5年以上的老棚，菌肥更能发挥其增产抗病的优势，成了很多菜农获取更高棚室效益的法宝。它是以微生物的生命活动及产物来改善作物抗病、抗逆能力，提高作物产量、改善作物品质的。

目前菌肥主要是用于抑制土传病害，预防蔬菜死棵而被菜农施用的，其实它还有其它的作用，如提高蔬菜产量、改善蔬菜品质等，对棚室蔬菜生产的意义很大。连续2年的棚室黄瓜生产，白学亮施用了金满田生物菌肥和美国三帝BBB生物有机肥，获得了很高的效益。今年冬茬黄瓜种植在即，白学亮又开始考虑菌肥的使用问题了。他说：“今年我准备使用大源一号落地生根抗死棵。”

能增强蔬菜抗病、抗逆能力。大棚蔬菜连年种植、连作种植，棚内病源菌增多，病害加重，特别是土传病害更是让很多菜农朋友束手无策。而增施生物菌肥的目的之一就是通过以菌抑菌的方法，增加土壤中有益菌的数量，抑制有害菌的发生和繁衍。

能提高肥料利用率。菌肥首先是一种肥料，自身含有一定数量的营养元素，可被作物吸收利用；其次它还能固定空气中的氮，释放土壤中固定态的磷、钾供作物吸收利用，实现长效与速效相结合均衡供应作物所需养分的作用，从而起到了不早衰、提高产量的效果。

能改善蔬菜品质。随着蔬菜种植面积的不断扩大，人们对蔬菜品质的要求越来越高，如何提高精品果（瓜）率备受种植户关注，而菌肥就具有提高品质的作用。菌肥施入土壤后，在土壤中产生的代谢产物能刺激果实的生长，促进果实的发育，从而达到提高品质的效果。

菌肥的作用虽大，但是菌肥在施入土壤后大量繁殖形成强大的有益菌群才能发挥其最佳效果，因此需要早施。一般情况下在定植前沟施或穴施即可，每亩用量80-120公斤为宜。并且在使用菌肥时，还要注意不要与杀菌剂一起施用，如施用落地生根抗死棵时不能与铜制剂或链霉素等杀细菌的药剂一起使用，以防杀菌剂将菌肥中的活菌杀死。