氟吗啉对霜霉属、疫霉素病菌特别有效。对葡萄、马铃薯和番茄上的卵菌纲，尤其是霜霉科和疫霉属菌有杀菌效力，可与触杀性杀菌剂（二噻农、代森锰锌或铜化合物）混用。人们一直存在着疑问，那就是氟吗啉与同类杀菌剂比较效果如何呢？具体情况如下：

吗啉类杀菌剂发展比较缓慢，除氟吗啉外目前商品化的品种仅有4个，克啉菌、吗菌灵、丙菌灵酰吗啉，除烯酰吗啉外其它三个杀菌剂主要用作防治白粉病，对卵菌纲真菌无活性。室内及田间试验结果表明，与烯酰吗啉比较保护效果二者基本一致，而氟吗啉治疗活性更高，且持效期较长。目前防治由霜霉属和疫霉属真菌引起病害的常规杀菌剂主要以酰胺类为主，如：甲霜灵、苯霜灵、恶霜灵，但这两类病害已明显对酰胺类化合物产生抗药性，因而防治效果很差；另外一类是脂肪族杀菌剂，如：丙酰胺、霜脲氰、杜邦克露（即霜脲氰和代森锰锌的混剂），这类杀菌剂在我国大部分地区也有不同程度的抗药性问题发生。除此之外，有机磷类、硫代氨基甲酸盐类如代森锰锌、福美双等对霜霉属和疫霉属引起的病害也有一定的预防作用，乙磷铝由于抗性问题现在防效不太理想，代森锰锌为保护剂，病害发生后使用无治疗作用。

总之，与目前国内市场上防治同类病害的常规药剂相比氟吗啉及氟吗锰锌药效突出、用量低、活性高、施药间隔期较长，尤其对抗药性发生较严重的地区试验结果反映的更明显。