轮状病毒种间的交叉感染已在人、牛、猪的实验室感染中得到证明，并曾在犊牛、仔猪和猴体内发现过人的轮状病毒；但是由动物到人的自然交叉感染尚未证实。

该病毒主要存在于病畜的肠道内，随粪便排到外界环境，污染饲料、饮水、垫草及土壤等，经消化道途径感染易感家畜。病愈动物从粪中排毒持续至少三周。成年家畜可以受到新生病畜的传染。更重要的是轮状病毒可以从一种动物传给另一种动物（如人轮状病毒能使猴、仔猪和羔羊感染发病，犊和鹿的轮状病毒均可感染仔猪等），只要病毒在一种动物中持续存在，就有可能造成本病在自然界中长期传播。这也许是本病普遍存在的重要原因。本病多发生在晚秋、冬季和早春季节。应激因素，特别是寒冷、潮湿、不良的卫生条件、饲喂不全价的饲料和其他疾病的袭击等，对本病的严重程度和病死率均有很大影响。