单生或排列成总状花序,具苞片,花有喇叭形、钟形,花被反卷或开张;雄蕊6枚,花呈丁字形着生,雌蕊3心皮,子房上位,3室。百合一般在6月上旬现蕾,7月上旬始花,7月中旬盛花,7月下旬为终花期。果期7—10月,一般百合花很少结实,单果有种子200粒以上,千粒重为2.08—3.4克。种子为近圆形薄床状,黄褐色,每粒种子的中间有一个长条形的胚,是发育成未来新植株的雏形,胚的外面包围着近圆盘形的胚乳,胚乳是胚发育时所需要的营养仓库。种子边缘有一圈透明状的薄膜,称为翅。在自然环境中,这种翅有利于种子随风散布。繁衍后代。