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口蹄疫病毒呈球形，放大150万倍后似小米粒大小。该病毒目前有7个型，包括O型、A型、C型、亚洲1型(Asia-1)、南非1型（SAT1）、南非2型（SAT2）、南非3型（SAT3）。不同型之间不能互相免疫，即用某型疫苗免疫注射动物后，只能预防该型口蹄疫，不能预防其它型的口蹄疫，但各型的症状相同。

口蹄疫病毒对外界环境的抵抗力较强。自然条件下，含病毒的组织和被污染的饲料、饲具、皮毛及土壤等可保持传染性达数周到数月之久，在低温和有蛋白质保护的条件下，病毒的存活时间更有长。但在直射日光下，60分钟后病毒就可死亡。另外，口蹄疫病毒对酸和碱十分敏感。因此，1％～2％的苛性钠，3％的草木灰，1％～2％的甲醛溶液等都是口蹄疫的良好消毒剂。但食盐、酚、酒精、氯仿等消毒药物不能杀灭口蹄疫病毒。