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银耳的原种和栽培种，都要求银耳菌丝和香灰菌丝比例适当。白毛团生长正常，在代料培养基上不易开片，原种35～40天长满，栽培种30～35天长满并有胶质化现象的适于段木栽培。在菌种表面形成白毛团后，较快胶质化和组织化，出现原基并较快开片的适于代料栽培。

银耳菌种的优良程度，不仅是要求银耳菌丝生长好，而且要求香灰菌丝生长好。在菌种生长中，香灰菌丝生长快，爬壁能力强，分布均匀，初灰白色，后产生灰黑相间的花斑，黑色素多，黑色斑纹多的为好。银耳菌丝较香灰菌丝细，均匀地分布于培养基中，白色。菌种呈现黑白混合的外观。

如果香灰菌丝稀疏，向下生长缓慢，表面的原基胶质化后不开片，表明培养基湿度过大，如果原基出现过早(10～15天)，或“白毛团”很多且小，表明菌种混合培养后移植次数过多，不宜使用。如果瓶内只长香灰菌丝，表面没有“白毛团”，表明银耳菌体的比例过小，这样的菌种生产上绝对不可使用。

优良的原种接种后18～22天出现胶质化原基，有原基的菌种才可使用。