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食用菌本身是保健食品，与农作物相比较，生产周期短。多种病虫害又多发生于出菇期，出菇期每一潮菇的生长期多为5～10天，即菇体的生长期仅5～10天。此外，菇体的吸水力极强，一旦出菇期进行药物防治，菇体将残留有大量农药。这样，药物防治就比蔬菜等农作物困难得多。因此，食用菌病虫害的防治原则是以预防为主，综合防治，栽培措施控制，采后施药。具体体现如下：

(1)使用前的场所清理、卫生、消毒、灭虫。

(2)使用中的场所清洁卫生和消毒。

(3)使用后的场所进行消毒灭虫处理。

(4)菇房窗门的窗纱防护。

(5)保持食用菌生长的适宜环境条件，严防高温高湿。

(6)正确实施各项栽培技术，如覆土的消毒，培养料的发酵，给水等。

(7)必须用药物防治时，必须先采菇后施药。采菇时，大小全部采净，绝对不可将药物直接喷于菇体上。施药后一定要进行偏干管理，避免7天内出菇，而且必须10天以后出菇。

(8)出菇期药物防治时，必须使用高效低毒、低残留、残留期短的农药，严禁使用剧毒的残留期长的种类。