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香菇菌丝洁白、舒展、均匀，生长边缘整齐，不易产生菌被。在常规木屑麦麸培养基上，在25℃恒温培养， 750毫升菌种瓶，原种一般40～45天长满，在加有一定比例的玉米粉的木屑培养基上，菌丝更加浓密、洁白，生长期可缩短3天左右。在相对加富的各种培养基上，气生菌丝都有不同程度的增加。在较高的培养温度(30℃或更高)下，培养基中的菌丝稀疏，生长边缘可见的丝状不明显。在高温条件下，培养基表面易出现分泌物，这些分泌物常由五色透明渐变为黄色至褐色，其色泽的深浅与品种有关。一般而言，起源于日本的品种色素较浅，中国种则色素较深。香菇菌种在有光和低温刺激下，常在表面或贴壁处有菌丝聚集的头状物出现，这是短周期品种和易出菇的标志。生长良好的原种和栽培种有浓郁的香菇味。