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为害食用菌的霉菌几乎可以在食用菌生长发育的各个时期出现，常见的有木霉、青霉、脉孢霉、曲霉、毛霉、根霉、镰刀菌、交链孢霉、疣孢霉、轮枝霉等，除后两类霉菌是致病菌外，其他霉菌都是食用菌的竞争菌，它们常引起食用菌各级菌种的污染，引起栽培中培养料发生霉腐，造成生产上的损失。