安全、有效地贮藏玉米种子十分重要，主要是因为玉米种子从产出到第一年春播，大约需要贮藏7个月左右时间。在贮藏过程中，如果保管不善，极易发生发热霉变与低温冻害等种子劣变现象。
    (一)贮藏特性
    玉米种子吸湿性强，呼吸旺盛。因为玉米种子的胚大，目含有30%以上的蛋白质和较多的可溶性糖。
    玉米种种子带菌量大，容易发生霉变。据测定，玉米种子经过一段贮藏后，其带菌量比其它禾谷类种子高得多，极易发生霉变。
    玉米种子胚含脂肪多，极易酸败。据测定，玉米种子胚部含有整个籽粒中77 %-89%的脂肪，使胚的脂肪酸高于胚乳。一旦出现酸败问题，先从胚部开始，从而影响玉米种子的发芽力。
    玉米种子收获时天气己冷，再加上玉米穗外有苞叶，新收获的玉米水分一般为20%-30%。玉米的成熟度很不均匀，再加上玉米种子脱粒时易损伤，这些损伤的籽粒极易受虫蛀和霉菌侵害。
    (二)常见贮藏方法
    籽粒贮藏。将收获后的玉米脱粒后，晒干扬净，使种子含水量降至13%以下，然后密闭仓房贮藏。
    果穗挂藏。将玉米苞叶编成辫，用细绳逐个捆绑成串，挂在通风良好且能避雨的地方贮藏。
    果穗堆藏。在露天场地上用秆秸编成圆形或方形的通风仓，将去叶的玉米穗堆在仓内越冬，第二年再脱粒入仓。
    (三)注意事项
    第一，要严格控制含水量。低温是种子贮藏的有利条件，但必须保证种子充分晒干，才能有效防止冻害。种子入仓及贮藏期间，含水量要保持在13%以下。
    第二，种子入仓时，要做到种子与食用粮分开，不同品种分开，好坏分开，干湿分开，新陈分开，有虫与无虫分开。种子袋、容器封口前应在容器内外各挂一枚标签，分别注明种子名称、数量、贮藏时间和级别。
    第三，不能用塑料袋装种子，也不能将塑料布覆盖在种子堆表面。因为塑料不透气，使种子与氧气隔绝，种子不能进行呼吸作用。
    第四，不能将种子与氮素化肥同室保管。因为大部分氮素化肥属铵态氮肥，极易挥发产生氦气，具有很强的腐蚀性，易使种子丧失芽率。
    第五，种子贮藏室(贮藏仓)必须做到顶不漏、地不潮，无鼠、无雀，地势高且十燥，远离灶台和其它火源。
    第六，在室外贮存的种子，遇冷后不应再转入室内;在室内贮存的种子，也不可突然转到室外，否则，温度的骤然变化，会使种子的发芽率降低。