在保管和使用包衣种子时一定要注意以下六个方面：
　　一是包衣种子一般有剧毒，只能做种子用，绝对不能食用或做饲料。包衣种子要存放在干燥、阴凉的通风处，严防小孩和家畜、家禽接触或误食。如有误食致死的畜禽，也应深埋地下，绝对不能食用，就连包衣种子出苗后所间的苗也不能用来喂畜禽，以免中毒。
　　二是播种包衣种子时要穿防护服，戴防护手套，小孩不能参与播种。播种时不得饮食、抽烟、用手擦脸，播种后立即用肥皂水洗净手、脸。
　　三是装包衣种子的包装袋应选用聚丙烯编织袋，最好不用麻袋，以免带毒麻袋纤维飞扬被人畜吸入导致中毒。包装袋用后应烧掉或深埋，严防误装粮食和食品。盛装包衣种子的用具须经彻底洗净后方可使用。洗涮这些用具的水严禁倒在河流、池塘和井池边，可倒在田间或树根周围。
　　四是包衣种子不宜进行浸种催芽。因种衣剂溶于水后可能会对种子的萌发产生抑制作用。
　　五是包衣种子不宜在低洼易涝地和盐碱地使用。包衣种子在高湿的土壤条件下极易发生酸败腐烂；在盐碱地，种衣剂遇碱会分解失效。在pH值大于8的田地不宜使用包衣种子。
　　六是包衣种子忌与敌稗等除草剂同时使用，播种后30天才能使用敌稗。如先用敌稗则需3天后再播种，否则容易发生药害或降低种衣剂的使用效果。