秋季是雨水过多的时期，我们要谨防雨季辣椒疫病。  
    农业防治。选用抗病品种，如羊角椒、细线椒等。实行与茄果类蔬菜2~3年以上的轮作，前茬以粮田、十字花科和豆科茬为好。育苗地要用未种过辣椒的新土，苗床要施足腐熟的有机肥，移栽时苗龄要在80天左右，株高15~20厘米，80%现蕾的大苗，移栽时最好用永业生命素泥浆沾根，可缩短缓苗期。定植密度要适当，每亩4000~4500株。特别是雨后要注意及时排水除湿，中耕松土，及时清除病株残果，减少传染源。
    药剂防治。播前可用20%甲基立枯磷乳油1000倍液浸种12小时，晾干后催芽播种。辣椒生长期间，喷药可用58%甲霜灵·锰锌可湿性粉剂500倍液，或 64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液，或70%乙磷·锰锌可湿性粉剂500倍液，或80%三乙磷酸铝（乙磷铝、疫霜灵）600倍液，每7~10天喷1次，连续喷3~4次。为降低病害的抗药性，以上几种农药可交替使用。