有些地区高温高湿天气持续时间较长，极易大面积爆发油菜菌核病。采用综合防治才是让油菜生长的最佳方法。
　　1、综合防治
　　（1）实行稻油轮作，避免连作。菌核长期淹水容易腐烂，可减少菌源。（2）选用早熟、高产、抗病品种，一般幼苗期叶色深绿、花期短、分枝部位高、茎杆坚硬抗倒的品种较抗病。
　　（3）春季注意清沟防渍工作，开深沟排水，做到雨停不积水，以降低地下水位和田间湿度。（4）深耕深翻、深埋菌核；及时中耕松土（特别是3月下旬至4月上旬），破坏子囊盘，减少菌源，并促进油菜生长健壮，提高抗病力。
　　（5）加强田间管理 合理施用氮肥，避免开花结角期陡长倒伏或脱肥早衰，采用高畦栽培和"宽窄行"栽培，有利通风透光，便于田间操作管理。适当配合磷钾肥和硼、锰等微量元素肥料。冬油菜区3月份对前一年种过油菜的旱地中耕l～3次，以破坏子囊盘。重病区可于花期摘除植株中、下部病、黄叶1-～3次，拾出田外处理。
　　2、药剂防治。油菜进入花期，茎病株率1%以下时喷药防治。可用40％菌核净可湿性粉剂1-000～工500倍液，或70%甲基硫菌灵可湿性粉剂600-800倍液喷雾。施药时应注意喷在油菜中下部茎、叶上（特别是主茎上），以提高防治效果。对感病品种和长势过旺的田块应在第一次施药后的一星期左右，再喷药防治一次。
    综合防治措施：防治本病应以预防为主，抓紧花期药剂防治。