套袋苹果要巧选农药进行病虫害防治。此时防治病虫，减少越冬病虫数量，为来年病虫防治打下良好基础。特别是苹果绵蚜，采果后仍是发生高峰，是防治关键时期，另一方面，老叶片的抗药性强，果实已经采摘，很少发生药害。对苹果绵蚜的防治除全园喷药外，发生严重的树要重点防治：在大剪口、锯口等绵蚜聚集的地方抹泥后包裹塑料膜，闷死虫子。喷药可选用的药剂有1500倍液的乐斯本或1000倍液的毒死蜱等。苹果球坚蚧10月上旬开始从叶片返回枝条越冬，此时仍是小若虫，没有分泌蜡质，一般药剂都可以防治，如：吡虫啉、高效氯氢菊酯、毒死蜱等。防治毛虫类可选用的药剂有：高效氯氢菊酯、苦参碱、毒死蜱等。 防治红蜘蛛、二斑叶螨可选用的药剂有：1.8％的阿维菌素、15％的哒螨灵等。最后，全园认真清理病虫枝，包括刮治腐烂病、剪除枝枯型腐烂病病枝、蝉类危害的死枝等，将这些病虫枝带出果园烧毁。所有剪口、锯口都涂药保护。