正确操作灌溉施肥是很重要的：
    溶解与混匀
    施用液态肥料时不需要搅动或混合，一般固态肥料需要与水混合搅拌成液肥，必要时分离，避免出现沉淀等问题。
    施肥量控制
    施肥时要掌握剂量，注入肥液的适宜浓度大约为灌溉流量的0.1%。例如灌溉流量为50立方米/亩，注入肥液大约为50升/亩；过量施用可能会使作物致死以及环境污染。
    灌溉施肥的程序
    第一阶段，选用不含肥的水湿润；第二阶段，施用肥料溶液灌溉；第三阶段，用不含肥的水清洗灌溉系统。