近年，新疆玉米育种工作取得较大进展，加上新品种的采用、生产条件及栽培技术的改进，玉米的总产及单产均有很大提高，尤其是单产水平一直处于全国首位。
一、新疆玉米育种及应用
1.新疆玉米育种现状
①玉米育种发展迅速，成就显著 新疆玉米育种工作起步较晚，近年，随着农业产业结构的调整，玉米需求的扩大，玉米育种发展迅速，取得了一定成果，审（认）定了一大批优良玉米新品种。2003年度自治区审（认）定通过的玉米新品种：新玉15号，新玉16号，新玉17号，新饲玉5号。2004年度自治区审（认）定通过的玉米新品种：新玉20号、新玉21号、新玉23号、新玉24号、新饲玉6号、新饲玉8号、新饲玉9号等。2005年度自治区审（认）定通过的玉米新品种：新玉31号，新玉32号，新玉33号、新糯玉6号等。新饲玉、新特玉（包括新糯玉、新甜玉）系列品种填补了新疆在青贮饲料玉米、特种玉米育种上的空白，满足了生产的需要，对新疆玉米产量提升、种植格局转变及产业发展提供了良好的种质基础。
②玉米育种机构发展迅速，竞争日益激烈 以前，新疆玉米育种单位仅限于新疆农业科学院粮食作物研究所、新疆农垦科学院作物所及兵团农科所等国有科研院所中，投入人力、资金有限，育种进展较慢。近年，疆内外大量专营或兼营玉米育种及生产的民营企业开始加入新疆玉米育种领域，在玉米育种上的投入不断增加，并取得了一定成就。
2.新疆玉米品种应用现状
①种子质量不断提高，单产稳定增加 近年新疆玉米种植面积稳定在50万公顷左右，据2004年统计，当年新疆玉米播种面积达到51.8万公顷，总产量362万吨，单产6979千克/公顷，远高于全国平均水平5120千克/公顷。新疆玉米单产高一方面是因为新疆优越的自然光热资源及栽培技术的改进，另一原因就是良种在生产中的应用，根据玉米种子抽检情况来看，玉米种子达标率逐年提高，单产仍有很大增长潜力。
②种植结构发生转变，品种布局渐趋合理 近年来，新疆玉米种植结构发生了很大转变，改变了以往全疆大部分地区均以普通玉米为主的种植格局。畜牧业发展区的青贮玉米、粮饲兼用玉米及饲草玉米种植面积开始增加，玉米高产地区的总产和单产稳定增加，玉米制种基地面积不断扩大，各大城市周边地区的甜玉米、糯玉米种植面积有所增加，表明新疆玉米种植布局渐趋合理。
二、新疆玉米育种中存在的问题
1.种质基础狭窄
育种工作发展到一定水平后，种质的遗传基础狭窄就成为进一步提高的瓶颈。目前，我国玉米育种种质主要集中在Reid、唐四平头、旅大红骨和Lancaster等少数骨干系，客观上造成育种种质资源狭窄。虽然近年新疆在玉米育种上取得了较大进展，但在种质创新方面进展缓慢。随着商业化育种的深入发展，育种单位间的材料交换几乎停滞，这就使得本来已经狭窄的种质基础更难扩展。
2.抗旱、耐盐玉米新品种育种进展缓慢
新疆是我国主要的干旱地区之一，几乎所有的耕地都依赖于灌溉，土壤的沙化、盐渍化严重，而玉米生育期内需水量较大，对盐碱也很敏感，干旱、盐碱已成为制约新疆玉米扩大面积、提高产量的重要因素。近年节水、增水措施的使用部分缓解了新疆农业用水的压力，但从长远来看，培育抗旱、耐盐的玉米新品种才是解决干旱、盐碱威胁的根本途径。
3.青贮饲料玉米应用不足
新疆是我国主要牧区之一，但目前畜牧业整体水平不高，远低于国外畜牧业发达国家，与国内许多省、自治区相比也有一定差异，这与新疆作为全国重要牧区是不相称的。新疆冬季漫长，在此期间家畜优质饲草供应严重不足是制约畜牧业发展的重要原因。青贮玉米具有易吸收、高效价、高产量的特点，大力推广青贮玉米对发展新疆畜牧业、改善生态环境具有重要意义。近年，新疆青贮饲料玉米的种植面积有所增加，仅占玉米总面积的8%左右，产量远不能满足畜牧业发展的需要。
三、对新疆玉米育种的建议
1.扩大玉米种质资源
针对新疆玉米育种种质资源狭窄的问题，建议对已有优良种质潜力进行充分发掘，进一步改良；结合新疆本地生态条件，利用回交改良、群体改良、二环系选育等方法选育抗旱、耐盐的自交系，以满足新疆本地玉米育种需求；同时，积极从疆外、国外引进与已有种质血缘关系较远的玉米自交系，扩大种质资源，配置更多的杂交优势组合。
2.新疆玉米品种选育方向
针对新疆玉米生产中优质专用玉米品种类型单一、品种抗逆性普遍不好的问题，今后新疆玉米育种应向以下3个方向发展：首先是高产；二是优质特用；三是抗逆。
3.将生物技术应用于新疆玉米育种
利用生物技术与常规育种方法相结合的手段进行玉米新品种选育，将在优质特用玉米及抗旱、耐盐玉米育种中发挥重要作用，同时，生物技术也将在玉米杂交优势群划分、品种产权保护、种质纯度检测等方面显示出巨大优势，促进新疆玉米产业快速发展。
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