南瓜可以嫩果供食,也可以老熟果供食。贮藏的南瓜应取老熟果,采收标准为果皮坚硬,显现固有色泽,果面布有蜡粉,采收时要保留一段果梗,有人指出根瓜不宜作贮藏用,可先摘除,留主蔓上第二个瓜,贮藏的瓜不能遭霜打,要早播保证霜前有适当成熟的瓜果,生长期间最好不使瓜直接着地,可以在瓜下垫砖或吊空,并要防止阳光曝晒,收时谨防机械损伤。特别禁止活动、抛掷,否则内瓤震动易引起腐烂,南瓜采后宜在24~27℃放置2周。使果皮硬化有利贮藏,这时对成熟度较低的瓜尤为必要。
南瓜可贮放在空屋内或湿度较低的窖内,保持温暖干燥的条件,适温在10℃左右,相对湿度70%~75%,贮藏时地面铺细沙、麦秸或稻草,其上堆放2~3层瓜,也可将瓜摆在菜架上。