果用银杏在9月份当外种皮呈橙黄色或自然脱落时即可采集。为便于收集应事先割除树冠下的杂草灌丛,再用竹竿击落。种子采回后,铺在地上,覆盖稻草或直接置于阴凉处摊放4―5天,待外种皮腐烂,淘洗干净,晒干后用麻袋或竹篓装好,置干燥处存放以防虫蛀。
叶用银杏在生长季节以留叶为主,分期分批采摘短枝上33%的叶片。先摘除树冠内和下部枝条上的老叶,待10月中、下旬叶片发黄即将落叶时大批采收,此期叶内所含类黄酮物质最多,对树体养分积累影响不大。采叶方法以手摘为好,切忌用木棍敲打,以免损伤树体,影响来年产量。采叶后若天气晴朗可将鲜叶在地面上摊晒,经常翻动,晒干;如遇雨天可以火炕烘干,置干燥室内存放。