在灵芝栽培中，常因杂菌的污染造成不同程度的损失，其中绿色木霉是发生频率和危害程度最高的，在灵芝栽培的各个阶段均可发生。绿色木霉广泛存在于自然界的各种有机物质和土壤中，还常以分生孢子的形式漂浮在空气中，它适应性强，特别是在营养丰富的基质上生长迅速，传播蔓延快，既可以和栽培的灵芝菌丝竞争养料，消耗养分，也可以分泌毒素破坏灵芝菌丝的细胞质，抑制灵芝菌丝的生长。在栽培中，如果采取了以预防为主并辅助治疗的措施，可取得较好的效果。
　　
　　一、选用抗杂性好、菌丝生长势强的灵芝品种。
　　
　　二、严格挑选栽培用种。所选菌种要求种性纯正，菌丝生活力强，菌丝洁白、浓密、健壮、菌龄适宜。
　　
　　三、搞好栽培环境的清洁卫生。要清除菇房内的菌渣、垃圾，彻底清洗栽培用架，并进行空间消毒，消灭杂菌隐匿场所，以减少传播媒介。搞好环境卫生对防止污染能起到事半功倍的效果。
　　
　　四、严格选料。培养料要求新鲜、无霉变，用前要暴晒数天，培养料配方要合理，主料和辅料要充分拌匀，含水量控制在60%～70%，装量合适，松紧适度，装好后立即进行高压或常压灭菌，以防培养基酸化。灭菌要彻底。
　　
　　五、接种时力保无杂菌污染。接种时操作人员的双手、衣物和所用接种工具、材料须严格消毒，接种动作要尽量快捷、熟练，防止接种过程中带入杂菌。对灭菌过程中破损的袋子要用胶布封好，并在封口处用75%酒精消毒。
　　
　　六、加大接种量。适当加大接种量，可使灵芝菌丝以绝对优势迅速占领地盘，减少杂菌的污染，起到以菇抑菌的作用。
　　
　　七、保证培养室内具有适宜的小气候，把好菌丝培养关。保持25℃左右的温度、60%―70%的湿度，注意通风换气，严防高温高湿，创造灵芝菌丝生长的最适宜环境条件，促进灵芝菌丝快速生长迅速占领整个料面。
　　
　　八、抓好出芝阶段的管理。灵芝原基长出后，要及时拔去棉塞或开袋，以免原基损坏而感染绿色木霉菌。做好保温保湿工作，同时加强通风，并给予一定的光照，促使原基健康地长成子实体，子实体成熟后及时采摘。
　　
　　九、加强早期防治。菌丝体生长阶段若发现料面有绿色木霉污染，可用石灰水擦洗患处，或用石灰浆封杀，或注射5%石灰酸液等；如子实体感染绿色木霉，应及时摘除，以防蔓延。用多菌灵和丰收纯的400～1500倍液拌料，对绿色木霉的抑制效果很好，但同样也抑制灵芝菌丝的生长。而用0.35克/升的氢氧化铜拌料，既能有效地抑制绿色木霉的生长，同时对灵芝菌丝的生长基本无影响。