由于病毒的侵染，使唐菖蒲植株产生茎叶萎缩，根部腐烂，花朵变形、变态，影响或失去观赏价值。目前国内唐菖蒲品种退化，病毒病的影响是其中一个重要因素。条斑病症状叶片产生褪绿斑点，至使扭曲变形，植株矮小，花朵变态，变小。

(1)菜豆黄花花叶病毒beanyellowmosaicvirus(BYMV)

菜豆黄花花叶病毒属马铃薯Y病毒科，未归属成员。患病唐菖蒲，病叶上形成褪绿花叶或褪绿斑点，多个褪绿斑点可形成长条斑。植株矮化，花小，有时出现碎色花。汁液、多种蚜虫和种球等无性繁殖材料可以传播病毒。云南省各唐菖蒲栽培基地均有发生，发病率30-35%。

(2)黄瓜花叶病毒cucumbermosaicvirus(CMV)

黄瓜花叶病毒为黄瓜花叶病毒成员，患病唐菖蒲，病叶上形成深绿和浅绿相同的花叶，叶片颜色失常，由深绿到浅绿，乃至变黄，有的成为黄白色或灰白色，成为斑块状的花叶，叶缘成波浪状，花草变矮，花穗变短，苞叶萎缩，花朵变小，花瓣皱缩，着花量减少，花被上出现白色斑块，使花朵黯然失色，严重者植株不能开花。汁液、多种蚜虫和种球等无性繁殖材料可以传播病毒。云南省各唐菖蒲栽培基地普遍发生，发病率45-50%。